在考虑预防心脏栓塞性中风时，至关重要的是要了解抗血小板药不是抗凝药。抗血小板药可防止白色血栓的形成（血小板聚集在快速流动的环境中，在动脉中或在心脏瓣膜上形成）。
在瘀点中形成的血栓，例如在房颤的左心耳，心室运动障碍和深静脉（导致悖论性栓塞）中形成的血栓，被称为红色血栓。它是由血纤蛋白聚合，形成类似于棉绒的长血纤蛋白丝网眼而形成的，并夹带了红细胞而产生的。
为防止形成红色血栓，必须使用抗凝药。这就是为什么抗血小板药在预防中风引起的心房纤颤方面远不如抗凝药有效。
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美国胸科医师学院建议将静脉血栓栓塞症治疗分为三个阶段：初始阶段，从诊断到第七天；长期的；长期的 并延长了时间。
在最初阶段，通常使用静脉注射抗凝药（普通肝素）或皮下抗凝剂（依诺肝素，萘达帕林，达肝素，丁扎肝素或磺达肝素）。
随后，在长期内，静脉或皮下治疗改为口服治疗，应维持至少3个月。在这种情况下，研究最广泛的药物是维生素K拮抗剂，其中华法林是最主要的代表。
华法林通过干扰维生素K和维生素K 2,3-环氧化物的周期性相互转化而发挥作用，因此阻止了维生素K依赖性凝血因子的合成（因子II，VII，IX和X）。
因此，直到循环中已经存在的因子被代谢后，华法林的抗凝作用才会发生，这一过程通常需要36-72小时。有效阻断该途径大约需要5天。3个月后，在长期疗程结束时，应评估是否需要继续抗凝药治疗，长期和长期使用华法林治疗已被证明可有效预防静脉血栓栓塞症复发。
但是华法林有很多缺点，比如它最明显的副作用就是出血，还有包括多种食物和药物相互作用，影响到患者的生活质量，还要担心副作用的产生，这就意味着最终的治疗效果欠佳。
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新型口服抗凝药对比传统抗凝药华法林，比较好的一点就是能够直接起效，不需要反复验血，抗凝效果比较稳定，而且起效快，药物代谢也比较快。
新型口服抗凝剂利伐沙班和阿哌沙班的优点是无需注射疗法，而采用纯口服疗法治疗静脉血栓栓塞症。
在第7天或第21天需要分别使用阿哌沙班和利伐沙班进行剂量调整，这将需要在医生和患者在过渡医疗期间进行重要沟通。
达比加群和依多沙班在治疗的最初几周不需要任何剂量变化，并且可以在患者出院后提供更简单的方法，但是可能需要最少5天的注射治疗。
但是新药是不能完全取代华法林，因为对于中或重度二尖瓣狭窄、换瓣手术后，华法林是不二的选择；肾功能不全的，尤其透析/血滤患者，华法林也是唯一可以使用的口服抗凝药。
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